Biuletyn Informacji Publicznej
Stosowane techniki oraz wykaz kluczowej aparatury
Techniki i metody
- izolacja DNA, RNA i białek z tkanek, płynów ustrojowych i kultur komórkowych,
- zabezpieczanie i przygotowanie materiału biologicznego do analiz, w tym homogenizację tkanek,
- projektowanie starterów i sond hybrydyzacyjnych do analiz ekspresji genów, polimorfizmu genetycznego oraz metylacji DNA,
- analiza restrykcyjna DNA,
- elektoforeza DNA w żelu agarozowym (standardowa i szybka)
- modyfikacja DNA z zastosowaniem wodorosiarczynem sodu
- techniki PCR: PCR klasyczny, RFLP-PCR, RT-PCR (synteza cDNA)
- ilościowa analiza ekspresji genów metodą qRT-PCR (SYBR Green, TaqMan)
- dyskryminacja alleli (SYBR Green, TaqMan, HRM)
- analiza metylacji DNA metodami MSP i qMSP (SYBR Green, MethyLight)
- analiza ekspresji microRNA (TaqMan)
- oznaczanie długość telomerów (TL) i liczby kopii mitochondrialnego DNA (mtDNAcn) metodą ilościową
- analiza ekspresji białek metodą Western blot
- analizę ekspresji białek i aktywności enzymów z wykorzystaniem metod spektrofotometrycznych i techniki ELISA
Aparatura
- termocyklery klasyczne (Bio-Rad) oraz termocyklery do PCR w czasie rzeczywistym CFX96 (Bio-Rad) LightCycler®96 (Roche) służące do analizy polimorfizmu genetycznego, metylacji i ekspresji genów
- średnio- i wysokoprzepustowy system do PCR w czasie rzeczywistym QuantStudioTM 12K Flex (Life Technologies) służący do analizy ekspresji genów, polimorfizmu genetycznego, microRNA, analizy mutacji genowych i detekcji patogenów
- automatyczny izolator kwasów nukleinowych z płynów ustrojowych, krwi, tkanek, osocza/surowicy chemagic Prepito®-D (PekinElmer)
- system do biobankowania: sample storage and tracking system with 2D barcode single tube and rack readers (Fluidx)
- czytnik fluoroscencyjny: VICTOR™ X3 Multilabel Plate Reader (Perkin Elmer)
- rozbudowany system do analiz metodą Western Blot (BioRad)
- homogenizator tkanek FastPrep-24™ 5G (MP Biomedicals)
