Biuletyn Informacji Publicznej
Ekspresja genów szlaku prezentacji antygenu MHCI u pacjentów z nieinwazyjnym rakiem pęcherza moczowego
Tytuł
Ekspresja genów szlaku prezentacji antygenu MHCI u pacjentów z nieinwazyjnym rakiem pęcherza moczowego
Nazwa zadania
-
Nazwa programu
-
Okres realizacji
-
Koordynator projektu
-
Koordynator projektu w IMP
dr Edyta Wieczorek
Jednostka realizująca w IMP
Zakład Badań Translacyjnych
Partnerzy
-
Instytucja finansująca
-
Wartość dofinansowania
-
Numer umowy
(2016/23/N/NZ5/01408)
Opis zadania
W przybliżeniu 75-80% przypadków raka pęcherza moczowego to nieinwazyjny rak pęcherza moczowego (NMIBC - non-muscle-invasive bladder cancer), pozostałe 20-25% to inwazyjny rak pęcherza moczowego (MIBC - muscle-invasive bladder cancer). Szczególnie NMIBC w tym klasyfikacje Ta, T1 i carcinoma in situ, charakteryzuje się wysokim ryzykiem nawrotu i progresji choroby. Dla 50–70% pacjentów z NMIBC obserwowane są wielokrotne nawroty, a dla 10–20% możliwy rozwój MIBC. Najczęstszym leczeniem wśród pacjentów z NMIBC jest przezcewkowa elektroresekcja guza (TURB - transurethral bladder resection) i dalsza obserwacja chorego w określonym systemie czasowym. Jedną z przyczyn niepowodzenia leczenia jest wznowa guza naciekającego na błonę mięśniową po TURB. Zbadamy jaki wpływ na powstanie wznowy raka pęcherza moczowego ma maszyneria odpowiedzialna za prezentację antygenu na poziomie ekspresji genów w białkach ścieżki antygenu zgodności tkankowej. Ścieżka ta jest dość skomplikowana z wieloma elementami. Jednak głównie białka transporter peptydów TAP (Transporter associated with Antigen Processing), ERAAP (ER endoplasmic reticulum, Aminopeptidase associated with Antigen Processing), tapazyna (TAPBP - TAP binding protein) i interferon gamma IFNγ są zaangażowane w ścieżki antygenu MHCI.
W planowanym projekcie proponujemy analizę profilu ekspresji genów odpowiedzialnych za szlak prezentacji antygenu MHCI tj.: TAP, ERAAP, TAPBP i IFNγ w tkance NMIBC, a także aktywności antygenów MHCI i IFNγ w osoczu. Zastosowana metoda badawcza. Materiałem biologicznym będą tkanki nowotworowe (n=95) i próby krwi (n=120) łącznie od 65 pacjentów. Z których zostało wyizolowane całkowite RNA, które następnie zabezpieczono i przechowano w biobanku Pracowni Genetyki Molekularnej i Epigenetyki, Instytutu Medycyny Pracy im. prof. dr med. Jerzego Nofera w Łodzi (IMP). Grupą badaną będzie stanowić 65 chorych z NMIBC, którzy przeszli leczenie TURB. Wybrani pacjenci zgłaszali się i byli leczeni w I Klinice Urologii szpitala im. Wojskowej Akademii Medycznej w Łodzi w latach 2013-2015. Dla wszystkich badanych pacjentów czas "I wizyta diagnoza" to moment w którym wykonywane było pobranie krwi oraz zabieg leczniczy TURB z pobraniem tkanki. Uwzględniony przez nas czas monitorowania wystąpienia wznowy trwał średnio 12 miesięcy od TURB, w tym okresie wystąpiła wznowa lub nie. To umożliwiło podział pacjentów na dwie grupy: na grupę bez wznowy (n=25) i na grupę ze wznową (n=35). Na matrycy mRNA wyizolowanego z tkanki, zostanie zsyntetyzowane cDNA za pomocą reakcji odwrotnej transkrypcji.
Sprawdzenie ekspresji wybranych genów TAP, ERAAP, TAPBP and IFNγ w tkance nowotworowej zostanie wykonane z wykorzystaniem technik qRT-PCR z barwnikiem interkalującym SYBR Green przy użyciu aparatu Real-Time LightCycler. Następnie zostanie zbadana ekspresja tych genów wraz z dwoma sprawdzonymi genami referencyjnymi (ACTB, GAPDH), z wykorzystaniem TaqMan® Array Microfluidic Cards - technika qRT-PCR z sondami TaqMan. Oznaczenie zostanie wykonane na aparacie QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System. Względna ekspresja genów będzie obliczana metodą 2-ΔCT z wykorzystaniem oprogramowania ExpressionSuite Software (Thermo Fisher Scientific). Oznaczenie stężenia MHCI i IFNγ wykonamy w osoczu pacjentów z rakiem pęcherza moczowego, przy pomocy komercyjnego testu immunoenzymatycznego ELISA. Wpływ spodziewanych rezultatów na rozwój nauki, cywilizacji, społeczeństwa. Wiadomo, że wznowy i przerzuty nowotworowe prowadzą do złego prognozowania choroby nowotworowej. Prawdopodobnie nawracający nowotwór pęcherza moczowego ma związek ze zmianą w ekspresji wielu genów istotnych także w procesach odpornościowych.
Tkankowa analiza profilu ekspresji mRNA białek wpływających na ścieżkę antygenu MHCI oraz zbadanie stężeń antygenu MHCI i IFNγ w osoczu przybliży rolę układu immunologicznego w tworzeniu wznowy u chorych na NMIBC po zabiegu TURB. Uzyskane wyniki także przybliżą znaczenie wykonywania oznaczeń molekularnych jako wskaźnik prognostyczny podczas monitorowania chorych.
Media społecznościowe projektu
-